Motivado por la proteína de espiga viral, apunta el complejo de proteínas con procedimientos de apostamors multiméticos

Para producir sintéticos y económicos, los aptámeros son opciones atractivas para anticuerpos para diagnósticos y terapéticas biomédicas. Cuando se requieren nuevos aglutinantes de aptámeros, por ejemplo, para detectar un nuevo virus, se desarrollan a partir de bibliotecas de millones de secuencias de ácido nucleico. Hasta ahora, tales bibliotecas consistían en solo carpetas monolantes. Pero esto es contrario a la estructura de muchas proteínas del mundo real, incluidas las proteínas SARS-CoV-2, influenza y espiga del VIH que son aligoméricas HOMO.

Desafortunadamente, el uso de aglutinantes monoovantes para estos complejos trímicos es un impredecible. De hecho, el jefe del Laboratorio de Biomateriales Programables en la Escuela de Ingeniería de Maartje Bastings, PhD, EPFL, lo comparó "arrojando un tazón de espagueti en la pared, porque algo definitivamente se quedará en algún lugar".

"No se puede controlar que un aglutinante monoovante interactúe con su objetivo: por ejemplo, puede unirse al lado de una proteína, más bien, en lugar de unir interfaces, reduciendo su funcionalidad", explicó Bastings. "En otras palabras, no puede elegir un lugar en la pared donde se adhiera un cierto fideos de espagueti. Por lo tanto, pensamos que no sería mejor para los carpetas que se ajustan a la geometría exacta del objetivo?

Ahora, Bastings y su equipo han reportado recientemente la primera técnica para la producción de multicpturas multimed, que se dirigen a complejos de proteínas con precisión y funcionalidad sin precedentes. De hecho, los aglutinantes desarrollados con perspectivas de laboratorio, MedUSA (ensamblaje supermolecular basado en ADN multicolor) se denominaron, produciendo enlaces que son de 10 a 1,000 veces más fuertes que los obtenidos con los aglutinantes de monopolynt. Además de ser fuertes, también resultaron ser muy selectivos, lo cual es importante para el diagnóstico.

Se publica en el trabajo Nanotecnología de la naturaleza En papel "Desarrollo del ensamblaje supermalaper múltiple de aptámeros con organización espacial definida por el objetivo.,

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Los autores mencionaron que usaron "Medusa" para desarrollar las reuniones multirregionales de Aptamererere con la vacante interlinición precisa y la simetría de tres veces, lo que refleja la estructura geométrica de varias proteínas de la cápside viral. ,

El andamio clave es el andamio clave de los aglutinantes trimíticos: una estructura molecular alrededor de la cual tres unidades de unión se reúnen naturalmente. En sus experimentos, los investigadores desarrollaron su andamio basado en la geometría de la proteína SARS-CoV-2 Spike. Al agregar estos cebollos cubiertos a su biblioteca AptMarmerame, el equipo pudo sesgar la secuencia de secuencias hacia los candidatos trimméricos que vincularían funcionalmente la interfaz objetivo correcta desde el principio.

"Es posible conectar el formulario a la función", dijeron los autores ", dijeron los autores," los autores dijeron, "los autores dijeron," es posible conectar el formulario a la función, como se muestra en el diseño del sensor fluorescente que se puede ver ", dijeron los autores.

"Tenemos ingenieros retro vistos en el virus, con complejos moleculares multimoleculares desarrollados conjuntamente, y lo traducimos en un nuevo método de búsqueda de aglutinante que nos permite seleccionar los aglutinantes de poligamia que bloquean los virus", dijo el primer estudiante graduado y el primer autor Artem Kononco.

Una vez que se identifica el primer lote de carpetas, los candidatos con afinidad creciente con su objetivo se desarrollan a través de un proceso de recurrencia de selección y amplificación llamado "evolución".

Aunque el diseño del nuevo andamio puede llevar unas horas, el proceso de desarrollo puede llevar semanas. Mirando aún más, el equipo de investigación tiene como objetivo reducir la fecha límite para que las necesidades del diagnóstico y la terapética biomédica puedan ser una mejor demanda.

Otro objetivo es desarrollar aglutinantes multímicos dirigidos a patógenos con configuraciones más complejas como la fiebre del dengue (seis subunidades de unión) o el ántrax (siete). "Finalmente, queremos usar este nuevo espacio de secuencia multivorante para entrenar los modelos genéricos de inteligencia artificial para nosotros", dijo Bastings.