El enfoque de IA crea una base de datos de datos genómicos clínicamente relevantes de Genomenon

A medida que crece la cantidad de datos genómicos, también aumenta el desafío de organizarlos en una base de datos útil. De hecho, la falta de bases de datos con capacidad de búsqueda de información genómica de la literatura ha presentado un desafío para la comunidad de investigación. Ahora, el enfoque basado en IA de Genomenon: Genomenon Genomic Graph (G³) Base de conocimientos: combina datos biológicos y de pacientes de prácticamente todos los estudios científicos y médicos publicados, incluidos datos demográficos, características clínicas, fenotipos, tratamientos, resultados y genes y variantes asociados a enfermedades.

Entrenamiento de modelos de lenguaje grandes subyacentes para G³ Utiliza conjuntos de datos genómicos seleccionados y patentados de Genomenon. La base de conocimientos impulsará modelos predictivos basados ​​en IA para aplicaciones de diagnóstico clínico y desarrollo de fármacos.

Genomenon, con sede en Ann Arbor, Michigan, un proveedor de soluciones de inteligencia genómica, señala que este avance representa la primera vez que el contenido de toda la colección de literatura clínicamente relevante se capturará en una única base de conocimientos con capacidad de búsqueda.

La base de conocimientos incluirá genes, variantes genéticas, variantes del número de copias, variantes estructurales que incluyen eventos de fusión, asociaciones entre genes y enfermedades, medicamentos, fenotipos y datos demográficos y características de los pacientes derivados del contenido indexado de investigaciones científicas publicadas.

Además de permitir capacidades avanzadas de alerta y búsqueda de literatura biomédica (utilizando consultas en lenguaje natural para priorizar, interpretar y resumir artículos relevantes), esta tecnología proporciona información procesable sobre pacientes y enfermedades. También se puede utilizar para crear una base de datos interactiva con conocimientos y análisis de IA genéricos y estructurados para satisfacer las necesidades de las aplicaciones de evidencia del mundo real.

"Hay una gran cantidad de información clínicamente relevante en las investigaciones publicadas, pero su gran volumen la hace en gran medida inaccesible para los investigadores y médicos", afirmó Mike Klein, director ejecutivo de Genomenon. "con ji³ KnowledgeBase, estamos organizando todos los datos e información clínicamente relevantes en una estructura con capacidad de búsqueda. Al utilizar un enfoque completamente nuevo para las bases de conocimiento y la minería de datos, hemos cambiado por completo los tipos de preguntas formuladas. Ahora se pueden revelar nuevas conexiones que de otro modo permanecían ocultas en lo profundo de la literatura científica, liberando el potencial de los datos del mundo real y obteniendo nuevos conocimientos sobre las poblaciones de pacientes.

El entrenamiento de modelos LLM específicos genómicos en conjuntos de datos patentados y seleccionados por expertos de Genomenon aumenta la precisión de los modelos de IA. Estos conjuntos de datos incluyen contenido seleccionado para enfermedades de la línea germinal y cánceres de la plataforma de inteligencia genómica Mastermind de la compañía y Cancer KnowledgeBase.

"Desarrollar una base de conocimientos genómicos avanzados es una de las tareas más difíciles en términos de la complejidad de todo el cuerpo de la literatura, los detalles de la nomenclatura y la intensidad del impacto", dijo Jonathan Eads, vicepresidente de Genomenon Engineering. “Nuestra plataforma de inteligencia artificial, impulsada por nuestros grandes modelos de lenguaje genómico específicos, fue diseñada específicamente para manejar las complejidades de las tendencias históricas y las diversas descripciones del lenguaje natural, así como para desarrollar nomenclaturas y ontologías formales. Extraer con precisión entidades y sus relaciones a partir de décadas de publicaciones es una tarea compleja y desafiante, pero nuestra tecnología está equipada de manera única para resolverla y el resultado es excepcionalmente valioso.