El ribosoma viral puede acelerar el perfil

La vacunación ha revolucionado la atención médica, pero diseñarla es complejo, requiere tiempo y creatividad, especialmente para las vacunas contra los virus, que son difíciles de estudiar.

"Cada virus exige un sistema agrícola específico, algunos virus no pueden cultivarse en el laboratorio, y el virus altamente patógeno requiere características de alto control", han escrito un nuevo estudio que los autores han escrito Ciencia Del extenso Instituto de MIT y Harvard

"La mayoría de los virus son genéticamente diversos, lo que requiere un método que pueda evaluar múltiples variantes en paralelo", dijo.

Para abordar este desafío, los investigadores desarrollaron una técnica llamada perfil de ribosoma paralelo a gran escala (MPRP), que permite la identificación rápida de proteínas virales sin la necesidad de desarrollar un virus vivo.

Su método y hallazgos se describen en un documento ",Descubrimiento de ORFS pan-viral utilizando perfiles de ribosoma paralelos a gran escala,

Los autores escribieron: "La definición de Protos virales es importante para comprender el ciclo de vida viral y la creencia inmune, pero el panorama de las áreas traducidas es desconocido para la mayoría de los virus", escribieron los autores. A pesar del progreso en la tecnología de secuenciación, es difícil determinar el Protromo viral.

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Utilizando su sistema de alto rendimiento, los investigadores sintetizaron miles de pequeñas piezas de genomas virales, los clonaron a plásmidos y los transfirieron a células humanas. Esto les permitió estudiar con seguridad fenómenos de traducción viral en paralelo en una gran variedad de virus.

Al indexar las piezas de ARNm unidas al ribosoma, el equipo pudo identificar rápidamente, donde los ribosomas traducían activamente el ARN a la proteína, proporcionando evidencia directa, que estaba siendo utilizada por la célula. Identificó un ORF no declarado en 679 genomas virales ligados a humanos 4.208 antes.

Muchos de estos péptidos recién identificados se originan en ORF no cónico, que no comienzan con códigos ATG específicos o invaden muy pocas proteínas.

En un ejemplo, el equipo encontró péptidos virales a partir de ORF no médico presentados en las moléculas de antígeno de leucocitos humanos de clase I en células infectadas, que son necesarias para el reconocimiento del sistema inmune. Además, identificó cientos de ORF aguas arriba que podrían implicar el inicio de la traducción de proteínas virales.

Estas nuevas proteínas no solo mejoran la comprensión de las interacciones del sistema viral inmune, sino que también pueden apuntar a un nuevo diseño de vacuna o terapia antiviral.

Cientos de virus pueden acelerar el crecimiento rápido de la vacuna contra el perfil de ORF en virus sin manejar patógenos vivos, especialmente para los virus emergentes. MPRP es una plataforma económica-económica escalable que puede usarse para examinar otras secciones del virus o para estudiar la traducción viral en varias condiciones celulares.

Si bien se han encontrado miles de candidatos ORF utilizando MPRP, muchas de estas áreas no están protegidas y aún no se han detectado por completo.

Los autores concluyeron que su "estudio tiene un rendimiento de miles de candidatos para ORF inexplicable en cientos de virus humanos, lo que puede aumentar nuestra comprensión de la biología viral y contribuir al desarrollo de las vacunas".