En ASHG, Whole Genomics destaca soluciones de secuenciación para multiómica y transcriptómica espacial

Complete Genomics compartirá detalles de varias aplicaciones multiómicas y transcriptómica espacial basadas en su tecnología de secuenciación en la reunión de 2024 de la Sociedad Estadounidense de Genética Humana (ASHG). Muchos clientes también presentarán estudios de casos en la reunión destacando los beneficios de la tecnología de la empresa.

Según la compañía, su secuenciador insignia, el DNBSEQ-T7, ha experimentado una mayor adopción en el mercado durante el último año para secuenciar datos de ADN, ARN y proteínas. La plataforma DNBSEQ-T7 es capaz de generar hasta 7 TB de datos por día, con una longitud de lectura máxima de lecturas de extremo emparejado de 150 pb y una tasa de precisión de más del 99,9 %.,

Además de exhibir el DNBSEQ-T7 durante ASHG, Complete Genomics discutirá su cartera ampliada de soluciones de secuenciación para secuenciación de genoma completo, transcriptómica espacial, proteómica y secuenciación unicelular. También discutirán CompleteWGS, una solución integral de flujo de trabajo que aprovecha la tecnología de secuenciación DNBSeq. él Una mayor cobertura genómica proporciona una mejor secuenciación y clasificación de haplotipos de genes desafiantes.

solución de indexación

Complete Genomics exhibirá su instrumento DNBSEQ-G400RS FluoXpert, un secuenciador multifuncional que combina la secuenciación de alto rendimiento con la inmunofluorescencia múltiple (mIF). La solución está diseñada para admitir la detección espacial de proteínas in vivo y el análisis multiómico de datos de ADN/ARN y proteínas en un solo sistema.

Los asistentes también pueden aprender sobre el secuenciador de mesa DNBSEQ-G800, cuyo objetivo es proporcionar mayor precisión y lecturas más largas y de un solo extremo de 600 pb y más. Según la empresa, esta solución proporciona la lectura única más larga entre los secuenciadores de lectura corta. También tiene la tecnología CoolMPS, que según la compañía proporciona mejores variantes para diferentes aplicaciones. Esta solución es ideal para secuenciar regiones genómicas altamente variables o repetitivas, identificar variantes estructurales, secuenciar ARN transcriptoma completo y más.

La compañía también destacará su sistema de preparación de muestras digitales DNAmLab-D4 totalmente automatizado para preparar bibliotecas desde muestras de ADN o ARN hasta nanobolas de ADN en aproximadamente 2,5 años.,3,5 horas. Complete Genomics comercializa una solución para convertir bibliotecas de terceros para metagenómica, secuenciación dirigida, secuenciación del genoma completo y compatibilidad con dnBseq.

Finalmente, la compañía presentará DNBSEQ-G99, que, según afirma, puede proporcionar calidad de datos Q40 para una variedad de aplicaciones de secuenciación. Proporciona dos celdas de flujo independientes para transferir hasta 48 GB en menos de 12 horas para el PE150 (desde la carga en FASTQ), o hasta 96 GB en 30 horas para el PE300.

Por otra parte, la empresa ha tomado medidas para mejorar sus capacidades de análisis de datos. El mes pasado, anunció que integraría las plataformas DNBSEQ con el software Parabricks de NVIDIA para análisis secundario. Además de admitir una amplia gama de formatos de datos de secuenciación, incluidos los específicos de DNBSeq, Parabricks ofrece versiones actualizadas de herramientas populares de llamada de variantes, como Genome Analysis Toolkit y DeepVariant, que están optimizadas para la aceleración de GPU. Estas herramientas ofrecen sensibilidad y especificidad mejoradas, lo que las hace adecuadas para identificar variantes de baja frecuencia.

otras actualizaciones

Complete Genomics también anunció que será el distribuidor exclusivo de los productos STOmics en Estados Unidos. Fundada en 2020, STOMics proporciona una plataforma multiómica espaciotemporal imparcial de alta resolución impulsada por la tecnología Stereo-Seq. Como parte del acuerdo, Complete Genomics también está lanzando un programa de subvenciones para investigadores que quieran incorporar la transcriptómica espacial en su investigación.

El programa de subvenciones denominado Spatial Accelerator proporcionará acceso a tecnologías avanzadas de transcriptómica espacial para estudiar la expresión genética con resolución unicelular. A través del programa, la empresa ofrece reactivos y secuenciación gratuitos, así como capacitación y asistencia desde la preparación de muestras hasta el análisis de datos. Los investigadores podrán utilizar las soluciones especializadas de la empresa para muestras de chips grandes e incluidas en parafina fijadas con formalina. Los investigadores interesados ​​en los Estados Unidos pueden postularse a dos áreas específicas: la investigación del cáncer y el estudio del Atlas de tejidos.