Proteínas diseñadas por IA creadas novo de día con nueva alfasina

Las proteínas que se encuentran en la naturaleza representan casi una pequeña fracción de estructuras de proteínas casi infinitas que pueden estar teóricamente presentes. Al diseñar novo del día de proteínas, desde cero, los civiles pueden crear de manera más eficiente una serie de nuevas ciencias médicas para funciones biológicas específicas. En un nuevo estudio, los investigadores introdujeron una estructura con IA, que acelera este proceso, promover el diseño de proteínas hacia la terapética personalizada y los medicamentos precisos.

Estudio del Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL), titulado "Under" TítuloAlphadesign: un marco de diseño de proteínas novo de un día basado en Alphafold, Fue publicado recientemente Biología del sistema molecular,

El fundador y CEO de Denowai, Kashif Sadiq, dijo: "Este documento es una verificación científica de nuestro enfoque y es una base para que nuestra misión amplia explore y aumente el medicamento mediante el diseño de biología y cambio y aumente el medicamento".,

Proteína funcional

El equipo alemán comenzó su estudio generando secuencias y estructuras sin procesar de proteínas para adivinar cómo cambian las piezas a través de la unión. Probó sus estructuras diseñadas en muchos niveles, desde monómeros, desde demeros, para hacer cambios en la composición durante la unión, utilizando diferentes tipos de programas instalados.

"Nuestro método es lo suficientemente versátil como para diseñar proteínas con diversas propiedades, por ejemplo, proteínas que se predice que cambia la deformación en la unión, así como la predicción de la proteína para unir múltiples homeologías de una proteína, sin requisitos para que todos los modelos vuelvan a capacitar o ajuste fino", escribió por los autores.

Las pruebas han demostrado que las proteínas diseñadas por Alfasusin, "representan un enfoque basado en Halight, producen resultados comparables o mejores para los modelos de proliferación de proteínas de última generación".

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"La precisión es importante porque reduce la recurrencia del diseño requerida, intensifica el paso de los ensayos clínicos y aumenta la posibilidad de una mejor eficacia, perfiles de seguridad y éxito clínico", dijo Sadiq.

¿Pero trabajan in vivo?

Para verificar si su día de diseño de proteínas Novo puede funcionar en el sistema vivo, el equipo hace que los inhibidores activos sean apuntando a las proteínas de fase bacteriana. Típicamente, la infección por bacteriófagos aumenta la activación de toxinas para prevenir el desarrollo de bacterias, evitando así la infección. Si bien se determina la estructura de una toxina, RCAT-ECO1, el grupo tiene como objetivo detectar la efectividad de su estrategia para crear un inhibidor para RCAT-SEN2, que es una versión con una estructura de proteínas no confirmada.

Tratamiento de e coli Las colonias junto con los candidatos inhibitorios mostraron que su 19.3% del diseño detuvo a RCAT-SEN2 in vivo. Se confirmaron estructuras de diseño inhibitorias exitosas utilizando CD y RMN.

"Alfadsin representa un nuevo nivel de control en la biología computacional: promedio, la capacidad de generar nuevas proteínas con el trabajo dirigido. La función muestra que la IA puede estar más allá de predecir la estructura biológica para crear activamente nuevas habilidades moleculares", dijo "Jan Korbel, PhD, mayor y jefe de la cabeza del sitio dijo.

Sadiq dijo: "Hemos demostrado que Alfadsin puede generar proteínas que pretenden y actúan en los sistemas vivos, incluida la orientación compleja del sistema inmune bacteriano", dijo Sadiq.

Este trabajo representa un hito en la fabricación de proteínas de novo, sin embargo, los investigadores aceptan que se requiere más trabajo y más probado. Si bien lo funcional actual es una prueba del concepto para la utilidad de la fabricación de proteínas funcionales, se debe realizar mucho trabajo antes de usarse para aplicaciones clínicas.

"Después de todo, se traduce para dar mejores resultados para los pacientes", concluyó Sadiq. "Nuestra visión es que para una enfermedad dada, podremos diseñar la molécula médica adecuada algún día, desde el principio".