El contexto del pangenoma incluye 145 genomas de arroz salvaje y cultivado

Se forma un arroz un mapa de Pengenom que incorpora aproximadamente 150 genomas de variedades de arroz salvajes y cultivados, que captura la variedad genética que se encuentra en esta planta, incluidos los genes asociados con la resistencia a las enfermedades.

Este trabajo se publica Naturaleza En papel, ,Una referencia de Panogenom al arroz salvaje y cultivado,

Arroz agrícola asiático (Orza Satiava) Es un alimento importante para miles de millones de personas. Cambio climático y rápido crecimiento de la población global O. sativaTambién es una enfermedad y resistencia a las plagas, una prioridad de presión. Sin embargo, es igualmente importante, desbloquear la capacidad genética de su ancestro salvaje, Rafipogona de OrzaQue se adapta a un entorno diverso en miles de años.

En este estudio, los investigadores tomaron una secuencia de 145 genomas de arroz, incluidas 129 acceso salvaje y 16 variedades cultivadas, que son seleccionadas para su diversidad geográfica y genética. Principalmente avanzado PacBio High-Deity (HIFI) utilizando tecnología de secuenciación y métodos computacionales, creó la "Pangeonom" de la más alta resolución hasta la fecha, capturó el paisaje genético completo de arroz salvaje y expuso los cambios ocultos para la mejora de los cultivos.

Su análisis mostró que la novela ausente de un único genoma de referencia aceptado pares de 3,87 mil millones de secuencias genéticas (O. sativa Ssp. Bhi Cv. Nipponbare), así como 69,531 genes colectivamente penagenom (28,907 genes núcleo y 13,728 con genes específicos de arroz salvaje). Notable, aproximadamente el 20% de estos genes están presentes solo en arroz salvaje, asociados con muchos pacientes, como la inmunidad y la adaptación ambiental. Estos genes representan una "mina de oro genética" para desarrollar variedades de arroz modernas que sean capaces de comprender los insectos, las enfermedades y los desafíos climáticos.

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Utilizando estas secuencias de genoma de alta calidad, los investigadores también realizaron un análisis de haplotipo de genes de dominación principales tempranos en varios grupos de arroz cultivado asiático. Sus resultados confirmaron que toda la domesticación se originó en Loki Bhi Ancellor o IIIA, proporcionando un fuerte apoyo para la visión prolongada de una dominación temprana para todas las variedades de arroz asiático.

Los investigadores descubrieron un flujo genético amplio entre los grupos de arroz cultivados en el sur de Asia, lo que llevó a la clasificación de un subgrupo recientemente reconocido, introducciónIndicadorY el desarrollo de un amplio mapa de desarrollo y dominación del arroz.

En investigación de desviaciones genéticas entre Indicador Y Bhi- Dos subpecies principales de O. sativa-Ensemplares identificaron más de 850,000 polimorfismo de nucleótidos solteros y 13,000 variaciones de presencia para pérdida entre ellos. Estas diferencias se originaron principalmente de las desviaciones entre su genealogía ancestral y un gran obstáculo genético. BhiPara crear nuevas oportunidades para combinar genes beneficiosos de varias subpecies de arroz.

Rico en valiosos recursos genéticos silvestres, este datos de penagenómeno elásticos, proporciona una base poderosa para la investigación agrícola y la cría de plantas. Los científicos pueden hacer una mina de alelos beneficiosa, detectar el origen de los principales genes y comprender profundamente la adaptación ambiental del arroz y la plasticidad fenotípica. El estudio proporciona una hoja de ruta para desarrollar variedades de arroz que puedan resistir los extremos climáticos, requerir menos recursos y producir altos rendimientos.