La novela identifica el signo indel del futuro algoritmo de cáncer de algoritmo

Los científicos y sus colegas de la Universidad de Cambridge han desarrollado un algoritmo que identifica patrones únicos causados ​​por la inserción y la deleción en el ADN tumoral. La descripción del algoritmo, llamado prrdtect, se publica en un nuevo Genética de la naturaleza Título de papel "Un indel refinado proporciona información sobre la firma mutacional de taxonomía,

Como se indicó en el documento, los científicos desarrollaron algoritmo analizando secuencias de ADN de más de 4,000 tumores de siete tipos de cáncer del proyecto de genoma 100,000 de la Inglaterra Genómica. Estaban más interesados ​​en INDLES con mecanismos de reparación de ADN defectuosos, conocidos como disfunción de reparación post replicativa o PRRD.

Esta investigación hace el pre-trabajo de la autora principal de Serena Nick-Zenal, MD, Genética de la naturaleza Estudios y otros que analizaron miles de genomas del Proyecto Genomics Inglaterra e identificaron los primeros patrones invisibles de mutaciones relacionadas con el cáncer. Para el estudio actual, los investigadores se centran en el cáncer con una alta proporción de tumores con mutaciones PRRD que incluyen intestino, cerebro, endometrio, piel, pulmones, vejiga y cáncer de estómago.

Identificó 37 patrones diferentes de mutación indel en los siete tipos de cáncer involucrados en este estudio. Diez de estos patrones ya estaban asociados con causas conocidas de cáncer, como fumar y contactar con luz UV. Ocho patrones se asociaron con PRRD. Los 19 patrones restantes fueron nuevos y pueden asociarse con causas de cáncer que aún no se han entendido completamente o mecanismos dentro de las células que pueden estar equivocadas cuando hay un cáncer de células.

Inexplicación

Utilizó datos para diseñar el algoritmo PRRDTECT para identificar el tumor con una firma PRRD de una secuencia de ADN completa.

Los científicos creen que su algoritmo puede algún día ayudar a los médicos a averiguar qué pacientes probablemente deben responder a tratamientos específicos y aumentar sus posibilidades de supervivencia. Los tumores PRRD son más sensibles a la inmunoterapia y los científicos dijeron que el algoritmo puede actuar como un "detector de metales" para identificar a los pacientes que tienen más probabilidades de ser tratados con éxito con inmunoterapia.

"Para usar la genómica de manera más efectiva en la clínica, necesitamos dispositivos que nos brinden información significativa sobre cómo el tumor de una persona puede responder al tratamiento. Es especialmente importante en el cáncer donde la existencia es pobre, como el cáncer de pulmón y los tumores cerebrales", dijo Nick-Zonal ", dijo Nick-Zonal, lo que también es dicho por Nick-Zonal" es más probable que el cáncer sea tratado con éxito con la reparación de la Da Defectuosa. Prrdetect nos ayuda a identificar mejor a los cáncer y, a medida que atendemos más y más cáncer en la clínica, eventualmente puede ayudar a los médicos a adaptar un mejor tratamiento para pacientes individuales ".