Directrices de sintaxis del gen para aumentar la expresión y la predicción

La expresión génica significa una gran diferencia y relación, basada perfectamente donde los genes se encuentran en un plásmido (sintaxis del gen), son descubiertos por investigadores de Dartmouth College. Esta nueva comprensión ayudará a los biomanufactores a diseñar plásmidos más efectivos y circuitos genéticos y, por lo tanto, habilitar la actividad promotora, la expresión génica más precisa y las mediciones más precisas de los sistemas de ingenieros más pronosticados.

recientemente papelEl escritor principal Yiji Deng, informó con PhD, investigadores científicos, colegas que "Jean generalmente muestra el nivel de manifestación alta como la réplica original (ORI) de un plásmido alineado en la misma dirección", en comparación con el gen colocado en la dirección opuesta. Dos genes adyacentes en orientación desviada, dicen, "para suprimir la expresión de los demás". Cambiar el orden génico mientras se mantiene su orientación logra varios niveles de expresión.

Como dice Deng General"Para aumentar la producción de proteínas, los genes dirigidos deben colocarse en la misma dirección que el eufemismo en un plásmido, lo que aumenta la expresión. En la ingeniería metabólica, organizando los genes enzimáticos limitados de velocidad en el orden y la orientación correctos pueden ayudar a las células a producir sustancias más deseadas". Además, dice: "Evite mantener los genes juntos en diferentes orientaciones juntos, ya que pueden interferir entre sí y reducir la expresión de los demás".

El informador de proteína fluorescente verde (GFP) en un plásmido redujo sus niveles de expresión del 12% al 30% en función de las construcciones de plásmidos, Deng y sus colegas al cambiar la dirección del gen informador. El intercambio de posiciones de GFP y proteína fluorescente roja (RFP) -gran GFP cambió la expresión del 15% al ​​31%, y la expresión de RPF del 4% al 17%.

Los IFFL también afectados

La sintaxis del gen también afecta el comportamiento del circuito genético, como los bucles de alimentación inconsistentes (IFFL), y "contribuye a resultados inesperados en la red genética", encontró.

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En la versión IFFL en la que el factor de transcripción ARAC-RFP y PSC101 PSC101 PSC101 PSC101 ORI coincidente del ORI de los plásmidos coincidentes, la expresión de GFP alcanzó aproximadamente 70,000 unidades arbitrarias (AU) después de ocho horas, y luego alcanzó una posición estable. La versión que usa ubicaciones frontales nunca excede los 10,000

Esa tendencia se realiza a través de la expresión de GFP en estado estable cuando se introdujo arabinosa, y para la variación de célula a célula de la expresión de GFP. En cada experimento, los niveles para los IFFL fueron claramente más altos cuando se codificaban el factor de transcripción y el plásmido.

Deng dice que esta tarea también se aplica a la "biología sintética y la medicina inteligente ..., como el uso de microbios de ingenieros para producir insulina en respuesta a los niveles de azúcar en la sangre. Lograr una regulación tan precisa depende cuidadosamente del diseño del circuito genético, que el diseño del circuito genético, que implica la arquitectura plasmídica, para garantizar que el momento adecuado esté activo en el momento adecuado para garantizar que el tiempo correcto y el tiempo correcto para garantizar que el tiempo correcto esté activo en el tiempo correcto.

Para los biomanufactores, significa que se presta más atención a la sintaxis de genes.